Tamaño: el atún rojo suele ser más grande y pesado que el atún amarillo, pudiendo llegar a medir hasta 3 metros de longitud y pesar más de 600 kilos. En cambio, el atún amarillo es más pequeño y ligero, con una longitud media de 1,5 metros y un peso medio de 50 kilos.
Sabor: el atún rojo se caracteriza por tener una carne más oscura y grasa, lo que le da un sabor intenso y muy apreciado. Por su parte, el atún amarillo tiene una carne más clara y magra, con un sabor suave y ligeramente dulce.
Hábitat: el atún rojo es una especie migratoria que habita en aguas frías y templadas del Atlántico, el Mediterráneo y el Pacífico. El atún amarillo, por su parte, se encuentra principalmente en aguas tropicales y subtropicales del Pacífico y el Índico.
Precios: el atún rojo es una especie muy cotizada y por tanto más cara en el mercado, llegando a alcanzar precios muy elevados. El atún amarillo, aunque también es una especie valorada, suele tener un precio más asequible.
Estado de conservación: el atún rojo está considerado como una especie en peligro crítico de extinción, debido a la sobreexplotación a la que ha sido sometido. Por esta razón, su pesca está regulada y controlada en todo el mundo. En cambio, el atún amarillo se encuentra en una situación de conservación más favorable, aunque también ha sufrido una sobreexplotación importante en algunas zonas.